Лечение эндемического зоба во многом зависит от степени увеличения щитовидной железы. При небольшом увеличении ее размеров обычно назначают только йодид калия, при условии что в пище пациента будут продукты, богатые йодом. Это прежде всего морская капуста, морская рыба и другие морепродукты, а также грецкие орехи и хурма.

При снижении функции щитовидной железы также назначаются синтетические аналоги тиреоидных гормонов или комбинированных препаратов (тиреотом, левотироксин). При этом больному нужно регулярно сдавать анализы, чтобы контролировать содержание гормонов щитовидной железы в крови.

При узловой форме зоба, если узлы большие или быстрорастущие и если они сдавливают окружающие щитовидную железу органы, рекомендуется хирургическое лечение зоба. После операции для предупреждения повторного развития зоба назначаются гормоны щитовидной железы.